| 主査 | ||
| 矢川 元基 | 東洋大学 工学部 教授 |
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| 委員 | ||
| 石井 芳 | 日産自動車株式会社 グローバル情報システム本部 主管 | |
| 伊藤 聡 | 株式会社東芝 研究開発センター 研究主幹 | |
| 宇佐見 仁英 | 情報・システム研究機構 国立情報学研究所 客員教授、富士通株式会社システム本部計算科学技術センター 研究部部長 | |
| 大島 まり | 東京大学 大学院情報学環 教授、東京大学 生産技術研究所 教授 | |
| 大野 隆央 | 物質・材料研究機構 計算材料科学研究センター長 | |
| 岡本 祐幸 | 名古屋大学 大学院理学研究科 物理学教室 教授 | |
| 奥田 洋司 | 東京大学 人工物工学研究センター 教授 | |
| 下條 真司 | 大阪大学 サイバーメディアセンター センター長・教授 | |
| 泰地 真弘人 | 理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター チームリーダー | |
| 鷹野 景子 | お茶の水女子大学 大学院人間文化研究科複合領域科学専攻 助教授 | |
| 中野 達也 | 国立医薬品食品衛生研究所 主任研究官 | |
| 根元 義章 | 東北大学 大学院情報科学研究科 教授 | |
| 羽生 貴弘 | 東北大学 電気通信研究所 教授 | |
| 姫野 龍太郎 | 理化学研究所 情報基盤センター長、理化学研究所 次世代スーパーコンピュータ開発実施本部開発グループディレクター | |
| 松尾 裕一 | 宇宙航空研究開発機構 情報技術開発共同センター チームリーダー | |
| 松岡 聡 | 東京工業大学 学術国際情報センター 教授 | |
| 松岡 浩 | 日本原子力研究開発機構 システム計算科学センター付 技術主席 | |
| 村上 和彰 | 九州大学 大学院システム情報科学研究院 教授、九州大学 情報基盤センター長 | |
| 室井 ちあし | 国土交通省 気象庁 気象研究所 予報研究部 主任研究官 | |
| 諸星 敏一 | 防災科学技術研究所 防災基盤科学技術研究部門 副部門長 | |
| 横川 三津夫 | 理化学研究所 次世代スーパーコンピュータ開発実施本部開発グループ ハードウェア開発チームチームリーダー | |
| 渡邉 國彦 | 海洋研究開発機構 地球シミュレータセンター プログラムディレクター |
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| 科学官 | ||
| 西尾 章治郎 | 大阪大学 大学院情報科学研究科長・教授 |
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| 合計24名 （平成18年7月31日 現在） |
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