任期：平成23年2月1日～平成25年1月31日
| 部会長 | 平野 眞一 | 独立行政法人大学評価・学位授与機構長 |
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| 部会長代理 | 深見 希代子 | 東京薬科大学生命科学部教授 |
| 甲斐 知惠子 | 東京大学医科学研究所教授 | |
| 鎌田 薫 | 早稲田大学総長 | |
| 小谷 元子 | 東北大学大学院理学研究科教授 | |
| 小林 誠 | 独立行政法人日本学術振興会理事 | |
| 佐藤 禎一 | 国際医療福祉大学・大学院教授 | |
| 鈴木 厚人 | 高エネルギー加速器研究機構長 | |
| 田代 和生 | 慶應義塾大学大学院文学研究科教授 |
| 岡田 清孝 | 自然科学研究機構基礎生物学研究所長 | |
| 北岡 良雄 | 大阪大学大学院基礎工学研究科教授 | |
| 金田 章裕 | 人間文化研究機構長 | |
| 小安 重夫 | 慶應義塾大学医学部教授 | |
| 鈴村 興太郎 | 早稲田大学政治経済学部教授・日本学術会議副会長 | |
| 谷口 維紹 | 東京大学大学院医学系研究科教授 | |
| 西川 恵子 | 千葉大学大学院融合科学研究科教授 | |
| 野崎 京子 | 東京大学大学院工学系研究科教授 |
| 家 泰弘 | 東京大学物性研究所長 |
研究振興局学術研究助成課