| 阿部啓子 | 東京大学大学院農学生命科学研究科教授 | |
| 主査代理 | 有信睦弘 | 株式会社東芝顧問 |
| 伊地知寛博 | 成城大学社会イノベーション学部教授 | |
| 小川温子 | お茶の水女子大学大学院人間文化創成科学研究科教授 | |
| 北川宏 | 京都大学大学院理学研究科教授 | |
| 栗原和枝 | 東北大学多元物質科学研究所教授 | |
| 黒木登志夫 | 独立行政法人日本学術振興会学術システム研究センター副所長 | |
| 小林信一 | 筑波大学大学院ビジネス科学研究科教授 | |
| 小間篤 | 独立行政法人科学技術振興機構イノベーション推進本部（戦略的創造事業）研究主監 | |
| 武田健二 | 独立行政法人理化学研究所理事 | |
| 沼尾正行 | 大阪大学産業科学研究所教授 | |
| 野田哲二 | 独立行政法人物質・材料研究機構理事 | |
| 主査 | 平野眞一 | 独立行政法人大学評価・学位授与機構長 |
| 山本雅之 | 東北大学大学院医学系研究科長・医学部長 |
（五十音順 平成21年8月4日現在）
科学技術・学術政策局計画官付評価推進室